赣州以北，新二镇进展顺利，先后夺取兴国、宁都、安远、瑞金、龙南、石城、长宁、会昌等县，又有信丰、雩都、安远、广昌、南丰等县举城反正。新二镇前锋甲旅兵进建昌府，建昌府清军不敢抵挡，往北面抚州方向逃窜。

太平军中军主力第一镇、第十五镇、新一镇及骑兵一部在大帅周士相亲自指挥下包围了吉安府城。因吉安一带暴雨如注，致使太平军行军困难，营盘安置也十分不便，原先定于以火药爆破吉安府城也因地湿不得行，故周士相只令各军将吉安团团围住，重挖深壕，重筑营城，每日以火炮攻城，不克不休。

吉安城中清军人心惶惶，粮食价格陡涨，生火木柴也短缺。清江西提督刘光弼派人向南昌告急，称内绝粮草，外无救兵，势难久待。清江西巡抚夏一鹗此刻却是一点援兵也调不出，反而要为南昌城的安危焦心竭虑。原来赣州被太平军攻占的消息传到江西各地后，便引发了一连串的反清起事。