在初步掌握了对多细胞植物结构的定向催化后，陈瑜随即将研究重点转向了更为微观但也可能更为根本的领域——复杂微生物系统的引导与进化。

他选取了之前在峡谷实验中催化出的、已表现出优异环境适应性的几种微生物作为新的基因模板。

这些微生物包括能够高效分解岩石矿物获取能量的化能自养菌，以及数种结构奇特、对强辐射具有卓越耐受性的古菌。

“启动定向进化协议‘贝塔序列’。”陈瑜向负责微生物单元的Bio-Unit-07下达指令，“核心目标：增强细胞膜在极端渗透压下的稳定性，优化其内部能量代谢路径的效率，并尝试引入基础的群体感应与协作机制。”

实验过程立即显示出创世粒子在操纵结构相对简单但生化网络极其复杂的微生物基因组时，所面临的高度敏感性。

最初的几个培养单元中，微生物群体在基因重组的关键阶段接连出现大规模崩溃，细胞结构普遍解体成为无定形的生物质残渣。

经过五次细致的能量参数与注入节奏的调整，陈瑜发现必须将引导能量场的控制精度提升至纳米级别，并精确匹配微生物的生命周期节律，才能确保外源基因序列的稳定整合与表达。