硅结体的前身是硅质体，硅质体最早的传播方式与病毒相似——侵入真核生物后会迅速控制其细胞核，把自己的遗传物质倒入其中。而当时的碳基细胞针对同类的免疫能力在这种混合基病毒面前基本上毫无作用。

当成功占领细胞核后硅质体便开始复制自己，若细胞被杀死，新复制的硅质体将继续寻找宿主。若细胞成功完成融合，细胞核就会停止复制新硅质体并且把部分已复制的硅质体变成细胞器，即硅结体。

硅结体外膜和碳基生物原本的生物膜差异不大，与真核细胞内质网相连。它能分泌可以把硅和其他无机物初步分解的酶，然后由真核细胞形成囊泡把这些酶送出去，再把原本碳基生物难以利用的初解无机物用囊泡运到硅结体，离子化后通过氧化还原反应获取能量，为真核细胞供能，同时保证混合细胞的硅源供应。

硅元素在与碳基生物的共生中渐入佳境，但碳硅混合生物的野心依然没有止步于真核细胞和低级动植物，它们又开始慢慢向中大型生物发展，开启了新一轮地域性物种大爆炸。

碳硅融合酶还有混合基因片段通过饮食等方式进入碳基大型生物体内，并融合入原初细胞中。于是大型生物渐渐在繁衍中也有了硅融合与基因融合功能。

与此同时，在这一阶段由于撞击带来的极端天气也在慢慢恢复，地壳运动形成的大陆桥的低洼地带与不稳定区域随着地壳的移动相继沉入海底。余下的大陆逐渐变成三个巨大的孤岛，既现在的冰岛，玄月岛与玉轮岛。