古方派独尊《伤寒论》，拒绝空洞理论，讲究实证研究。

这一派在17世纪末至18世纪初为草创期，代表人物如名古屋玄医主张“贵阳贱阴”说；后藤艮山主张“一气留滞论”。

18世纪中叶，随着吉益东洞“万病一毒”学术思想的提出，标志着古方派医学的正式形成。

古方派的特征包括《伤寒论》中心主义、批判主义和实证主义。

后世派的创始人是日本名医田代三喜，他将李东垣、朱丹溪等金元四大家的医学思想带回了日本。

这一派的学术思想强调以《内经》为基础，以李朱医学和后世派的学说为主导。

曲直濑道三是这一派的代表人物，他首创了腹诊术，并将自己的经验和古籍中的精粹结合起来，使汉方医学更加适合日本国情，因此被称为日本医学“后世派”的中兴之祖。