军事上，撒马尔罕原有驻军十万人马，为了保卫撒马尔罕，阿拉丁还调集十万骑兵协同作战。而此时由于难民的涌入，撒马尔罕人口达到二百万人，阿拉丁派人从中挑选四十万预备军协同守城。

工事修建上，阿拉丁让丞相秃儿干组织守城士兵和预备军一起加固城墙，使撒马尔罕的城墙增至五丈高。