丘福领大明水师，主要负责海上。

中部战区则是朱瞻基为指挥使，领天雄军，三千营和五军营，卫守北京。

北部战区则是汉王为指挥使，领神机营，新建制的北府军，镇守草原及建州。

南部战区则是张辅为指挥使，领南方全部地方军，整合为南府军，主要职责是镇守大明内部，同时管理南海。

西部战区则是赵王为指挥使，领肃州卫，凉州卫，宁夏卫等西部卫所，整合成西府军，镇守西部疆域，主要防范帖木儿帝国和乌斯藏。

每个战区都有一万超级士兵的编制，都是各府军的护卫队。

地方上，朱棣将士族消灭，用老兵担任理政，从此皇权不下乡成为了过去。

京城内，天雄军镇守城防，锦衣卫改组为四部，共四部指挥使。

青龙部，朱瞻墡为青龙部指挥使，负责监察百官，领昭狱职责。

朱雀部，朱瞻墉为朱雀部指挥使，负责监察天下，其职权在京外。

白虎部，汉王世子朱瞻壑为指挥使，这也是锦衣卫唯一对外的成军团的暴力机构，

白虎部负责皇宫城防和对内的镇压。