与原来拉神组合了阿图姆不同，阿蒙并没有融入九柱天神系统。

阿蒙作为底比斯的地方主神的时候有着自己不太完整的家族系统——这是很多地方主神的共同特点——他有自己的妻子和儿子。

成为全主神后，这个系统依旧伴随着阿蒙。

阿蒙的妻子是一位美丽的女神，叫穆特，儿子叫孔斯，是月神。阿蒙与妻子和儿子同住在底比斯的卡尔纳克神庙。

阿蒙和儿子之间还有这样一个故事：

阿蒙从来没有对人露出自己真正的形象，对儿子孔斯也不例外。

孔斯要求阿蒙在他面前显现真正的形象，阿蒙却不愿意破例，但又不忍心拒绝儿子的请求。

于是他用一只公羊的皮和头把自己包起来，在儿子面前出现。

孔斯以为自己见到了父亲的真相，然后把这个秘密告诉所有人。

从此不杀公羊，只有每年阿蒙的生日才杀一只，并会用它的皮把阿蒙的神像包裹起来。

起初，阿蒙仅是底比斯的地方神祇。

那时底比斯还只是尼罗河东岸一个不起眼的小镇，位于今日卡尔纳克神庙周边区域。