刘协登基后，董卓自封丞相，加封太师，完控制了朝政，在洛阳无恶不作，甚至最后还把洛阳一把火变成了一片废墟。

直至十八路诸侯并起，董卓逃到长安后来被王允等人所杀，刘协这才算松了口气。

刘协当时本以为这是汉王朝复兴的开始，却没想到口口声声为了汉室的王允，却转手也干起了把持朝政的勾当。

王允骄傲自满，气量狭小，根本稳定不了关中的局势，不久在贾诩的计谋下，李催郭汜两人击溃吕布，逼死王允，把持朝政。

然而这两人哪里是省油的灯，把持权柄后立马各自为战，根本不管朝堂天下死活，跟着三辅大旱，谷米价格腾飞，根据史料记载，当时的长安一斛谷米甚至价值钱五十万！

长安城中人吃人屡见不鲜，刘协命令手下官员开仓放粮，然而官员却回报粮食依然不够赈济灾民所需。

刘协当时便怀疑手下官员没有拿部粮草赈济灾民，而是趁机侵占公粮，他当机立断派人找来米、豆各五升，在自己面前熬制成粥，最后煮成两盆，证实官员的确是在作弊，当即责罚，随后再开仓救灾，长安的饥民这才有所保障，得到救济。

后来李傕和郭汜闹翻，李傕抢在郭汜前面将汉献帝刘协劫走，郭汜和李傕互相攻打数月，整个长安都沦为一片废墟。

幸亏李傕的部将杨俸和牛辅等人相聚，刘协这才摆脱控制，回到洛阳。

当时曹操听从部下尊天子以令不臣的提议，前往洛阳迎接刘协，并迁都许昌，从此许昌成为许都，曹操也拥有了号令天下的能力。

然而已近临危傀儡半生的刘协，亲眼目睹了大臣夺权的祸患，他怎会甘心沦为傀儡，长安的一幕幕在刘协心中反复，汉室荣耀更是让他食不能安，夜不能寐。